Bordeaux kopplade greppet om matchen direkt och när 20 minuter var spelade hade det franska laget en 2–0-ledning efter mål av Mélissa Daphne Herrera och kanadensiska OS-guldmedaljören Vanessa Gilles.
Kristianstads trotjänare Mia Carlsson reducerade sex minuter senare och höll liv i matchen innan nederländska anfallaren Katja Snoeijs stänkte in 3–1 för Bordeaux.
Svensklaget forcerade i slutet av andra halvlek och bollen dansade på mållinjen ett par gånger – men närmre än så kom man inte.
Därmed är Champions League-äventyret över för Kristianstad.