Stoppet är mellan Årstaberg och Älvsjö och berör både pendeltåg och fjärrtåg.
Enligt Trafikverket rör det sig troligen om nedrivna kontaktledningar.
– Våra pendeltåg vänder vid stationerna Stockholm City och Älvsjö, säger Andreas Strömberg på SL:s presstjänst till DN och hänvisar resenärer till alternativa färdvägar.
Det finns ingen prognos för när tågen kan gå som vanligt igen.